brain image preprocessing

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  1. convert between different image formats
  2. strip skull (FSL bet, or Bet for gui)
    bet brain.nii brain_noskull.nii
  3. register to a standard brain (FSL flirt, or Flirt for gui)
    Select avg152T1_brain.img as reference, use rigid body (6 parameters)
    A mat file will be produced.
  4. register to a standard brain, with skull
    First perform step 2 and 3
    Then run Flirt, click button “Utils”, select “Apply FLIRT transform”
    Input the mat file, the original image file (with skull). Output size: select the original image. Output file: give a new name

第三十期 fNIRS Journal Club 通知 2022/05/28,10am

三个臭皮匠顶个诸葛亮背后的机理是什么?浙江大学潘亚峰研究员将为大家讲解他们最近发布的一篇用三人超扫描研究合作学习的文章。热烈欢迎大家参与讨论。 时间: 北京时间2022年5月28日周六上午10点地点: https://zoom.com房间号: 869 5374 8016 密码: 383720 Pan, Cheng, Hu (2022) Three heads are better than one: cooperative learning brains wire together...
Xu Cui
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第二十九期 fNIRS Journal Club 视频

光子在大脑中是如何散射的?如何用计算机模拟的方法了解fNIRS的测量基础?来自波士顿大学的程小峻博士为大家分享他们近期在 J Biomed Opt 发表的文章。 Youtube: https://youtu.be/rbqGI3tSEBw Youku: https://v.youku.com/v_show/id_XNTg2NjgzMjk4MA==.html 相关资源: 文献鸟(追踪科学文献)文献大分析(两分钟了解一个领域)
Xu Cui
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第二十九期 fNIRS Journal Club 通知 2022/4/30,10:00am

光子在大脑中是如何散射的?如何用计算机模拟的方法了解fNIRS的测量基础?来自波士顿大学的程小峻博士将为大家分享他们近期在 J Biomed Opt 发表的文章。 热烈欢迎大家参与讨论。 时间: 北京时间2022年4月30日上午10:00地点: https://zoom.com房间号: 868 4070 8135密码: 655816 程小峻要讲解的文章如下: Cheng, Chen, Sie, Marsili, Boas (2022) Development of a Monte...
Xu Cui
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