Visualization with freesurfer

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Assume CON14 is our subject ID and it is inside directory $SUBJECTS_DIR.

After the display window and the control panel pops up, try playing with the menus and buttons.

tkmedit for volume

tkmedit CON14 rawavg.mgz
tkmedit CON14 rawavg.mgz lh.pial -aux-surface rh.pial
File > Load Segmentation > (for "Load Volume") aparc+aseg.mgz (for "Load Color Table") FreeSurferColorLUT.txt

tksurfer for surface

tksurfer CON14 lh inflated
tksurfer CON14 lh pial
tksurfer CON14 rh pial
File > Label > Import Annotation > (browse to) lh.aparc.annot

tkregister2 for check registration

tkregister2 --s CON14 --fstal

第三十期 fNIRS Journal Club 通知 2022/05/28,10am

三个臭皮匠顶个诸葛亮背后的机理是什么?浙江大学潘亚峰研究员将为大家讲解他们最近发布的一篇用三人超扫描研究合作学习的文章。热烈欢迎大家参与讨论。 时间: 北京时间2022年5月28日周六上午10点地点: https://zoom.com房间号: 869 5374 8016 密码: 383720 Pan, Cheng, Hu (2022) Three heads are better than one: cooperative learning brains wire together...
Xu Cui
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第二十九期 fNIRS Journal Club 视频

光子在大脑中是如何散射的?如何用计算机模拟的方法了解fNIRS的测量基础?来自波士顿大学的程小峻博士为大家分享他们近期在 J Biomed Opt 发表的文章。 Youtube: Youku: 相关资源: 文献鸟(追踪科学文献)文献大分析(两分钟了解一个领域)
Xu Cui
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第二十九期 fNIRS Journal Club 通知 2022/4/30,10:00am

光子在大脑中是如何散射的?如何用计算机模拟的方法了解fNIRS的测量基础?来自波士顿大学的程小峻博士将为大家分享他们近期在 J Biomed Opt 发表的文章。 热烈欢迎大家参与讨论。 时间: 北京时间2022年4月30日上午10:00地点: https://zoom.com房间号: 868 4070 8135密码: 655816 程小峻要讲解的文章如下: Cheng, Chen, Sie, Marsili, Boas (2022) Development of a Monte...
Xu Cui
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